L’intérêt porté par Marcel de Puydt à l’archéologie préhistorique remonte à son adolescence, période durant laquelle il fut initié au classement des collections du Musée archéologique de Namur grâce à l’historien et archiviste Jules Borgnet, père d’un ami. Attiré par les conversations des « savants » et des préhistoriens qu’il y côtoyait, il fit ses premières découvertes archéologiques dans les déblais des fouilles du préhistorien dinantais Édouard Dupont, dans les grottes de la vallée du Samson. Venu à Liège étudier le droit, il consacra ses loisirs « à la recherche de gisements préhistoriques et de silex dignes de figurer un jour dans les vitrines d’un musée ». A la fin de l’année 1879, il fut admis à l’Institut archéologique liégeois comme membre associé, puis trois ans plus tard, comme membre effectif. Il œuvra grandement à la mise sur pied, au Musée archéologique liégeois, d’une section Préhistoire - alors quasi inexistante - qu’il enrichit au fil du temps grâce à de fréquentes donations. Sa grande générosité et sa contribution constante à l’enrichissement des collections muséales sont parfaitement illustrées par une caricature de Jacques Ochs parue dans le Journal de Liége du samedi 21 août 1909. Le dessin qui figure Marcel de Puydt présentant un crâne d’ours est accompagné de la légende « M.rc.l d. P..dt (voyelles manquantes) l’homme des fonds de cabanes, directeur du Contentieux à la Violette (l’Hôtel de Ville) et grand pourvoyeur du second étage de la Maison Curtius » ! Profondément attaché à la Ville de Liège et à ses musées, il fit don à la Ville, en date du 4 juin 1920, de sa riche collection préhistorique, fruit de ses recherches personnelles durant près d’un demi-siècle et de fouilles menées à Spy (1886) et en Hesbaye (1888-1908). Parvenant à convaincre de nombreux amateurs de Préhistoire (Tihon, Davin-Rigot, Gaillard, Destinez, Cumont …) à déposer leurs collections au musée, il est à l’origine de la constitution d’une des plus importantes collections de Préhistoire du pays.
